Transféré depuis peu au Milan AC, Van Bommel doit son départ à sa relation avec son ancien entraineur, Louis Van Gaal : "Tout le monde sait ce qu'il se tramait et je n'ai pas besoin de me payer l'entraîneur. En fait, je ne voulais pas partir, mais les choses ont changé d'un point de vue sportif et je devais réagir" Le coach du Bayern Munich priviligiait l'espoir du club Toni Kroos ce qui reléguait Van Bommel sur le banc.